・國立臺灣大學理學院為鼓勵學術風氣，特設碩、博士生優良畢業論文院長獎。此獎項旨在表揚學術表現傑出的畢業生，名額原則上為當年畢業生人數的 10 % 以內。碩士班學生需以兩次專題討論報告成績前 50 % 者為候選，並繳交論文摘要進行外審評定；博士班學生則比照碩士班方式，於提出口試申請後參選。
・對象(須符合)：國立臺灣大學理學院碩士班或博士班畢業學生；碩士班學生：兩次專題討論報告成績排名前 50 %；博士班學生：提出口試申請後參選當年度院長獎
・碩、博士生優良畢業論文院長獎：名額以當年畢業生人數的 10 % 以內為原則
・申請：碩士班候選學生需於系上送交給獎名單截止日期前一週繳交論文摘要；博士班同學須提口試申請後參選當年度院長獎
・碩士班候選學生未繳交論文摘要者視同放棄；博士班同學若無法當學年畢業者將取消該年院長獎資格；博士班同學在學期間得申請參選院長獎，並以一次為限